Se conocen 250 especies y 45 géneros. Hay pocas especies de esta división en aguas dulces. La mayoría de las especies viven en plancton marino.

Posee representantes de las organizaciones monadal, capsal, cocal y trical, pero predominan los unicelulares monadales .

Las células flageladas presentan dos flagelos con pequeñas escamas de material orgánico, además presenta una estructura filiforme: haptotema que sirve para la fijación.

La superficie de la célula esta formada por escamas que se producen en golgi y que se depositan en el exterior.

Los cloroplastos de color amarillo, pardo… contiene clorofila a y c. Los cloroplastos se encuentran cubiertos por un repliegue del retículo endoplasmático, los tilacoides se disponen en montones de a tres, la mancha ocular se dispone en debajo de la membrana de cloroplastos.

Los pigmentos accesorios son beta carotina y xantofilas.

Como sustancia de reserva posee aceites y paramilo.